3 Chemie - 3BI - Onderdelen - Biochemische technologie    Component behoort tot O.O.: Onderzoekstechnieken Afstudeerrichting: CH:Chemie Code: 30300 Academiejaar: 2009-2010 Type: ? Niveau: ? Programmajaar: 3 Periode binnen het modeltraject: :-- Aantal studiepunten: nvt Wegingscoëfficient: 66 Totaal aantal contacturen: 54 Totaal studietijd: 154,44 Deeltijds programma: Vrijstelling of overdracht: niet mogelijk Onderwijstaal: Nederlands Lector(en): Partoens Peter   KORTE OMSCHRIJVING De rode draad doorheen de component "Biochemische technologie" is "de weg van gen tot eiwit" en sluit hierdoor zeer nauw aan bij het opleidingscomponent "Genexpressie, functie en werking". In de component "Biochemische technologie" worden de methoden besproken om cellen en weefsels te homogeniseren. De werking van verschillende detergenten en de mogelijke strategie voor nucleïnezuur- en eiwitzuivering worden behandeld. Alle technieken die hierbij aan bod komen (fractionatie, concentratiebepaling, bufferwissel, concentrering,enz…) worden in theorie gezien en in de component "geïntegreerd lab" toegepast. Nadruk wordt hierbij gelegd op de voorzorgen die nodig zijn om bv. denaturatie te voorkomen. Verder komen de diverse chromatografische en elektroforetische scheidingstechnieken aan bod en de toepassingen die ze in praktijk hebben. De theorie van deze component en het "Geïntegreerd lab" zijn zeer nauw met elkaar verweven. COMPETENTIEGERICHTE LEERDOELEN  Dit opleidingsonderdeel draagt in het bijzonder bij tot het realiseren van volgende opleidingsdoelen (eindtermen) Algemene competenties Algemene beroepsgerichte competenties CH242 brengt structuur in ideeën Beroepsspecifieke competenties CH367 heeft inzicht in de belangrijkste biochemische onderzoeksmethoden CH368 kent de courante biotechnologische en moleculair biologische processen CH370 functioneert in een wetenschappelijk onderzoeksteam SPECIFIEKE DOELSTELLINGEN kent de algemeen gebruikte scheidingstechnieken voor nucleïnezuren en eiwitten. kent de belangrijkste chromatografische en elektroforetische technieken, de apparatuur die daarbij gebruikt wordt en de belangrijkste toepassingen. kent de typische biochemische werkwijzen als homogenisatie, fractionering, dialyse, membraanfiltratie, blotten en centrifugatie en de apparatuur die hierbij gebruikt wordt. kent de algemeen gebruikte identificatietechnieken voor eiwitten en nucleïnezuren als o.m. de verschillende kleurreacties, autoradiografie en immunochemische detectie. kan onder begeleiding, nieuwe procedures ontwikkelen om eiwitten en nucleïnezuren te zuiveren en te karakteriseren en hierbij de juiste technieken en apparatuur gebruiken. Hij/zij is in staat deze technieken in diverse sectoren (biomedische sector, landbouw, voeding, milieu …) toe te passen. volgt de veiligheids- en afvalverwerkingsvoorschriften nauwgezet op en bezit een ethisch onderbouwd verantwoordelijkheidsgevoel. LEERINHOUDEN Dit opleidingsonderdeel bestaat uit drie grote delen: biochemische werkwijzen, elektroforese en chromatografie. Biochemische werkwijzen Water, diverse stoffen en buffers Eigenschappen van water Invloed van diverse stoffen Homogenisatie van cellen en weefsels Uitgangsmateriaal Activiteit van hydrolytische enzymen Homogenisatiemethoden Zuivering van en werken met nucleïnezuren Algemene strategie bij zuivering nucleïnezuren Beschadiging van nucleïnezuren Concentratiebepaling Denaturatie en renaturatie Isolatie en zuivering Zuiverheid - Identificatie Zuivering van en werken met eiwitten Algemene strategie bij zuivering eiwitten Efficiëntie van de zuiveringsstap Fractionering Verwijdering van zouten Bewaring Maken van een eiwitoplossing Detectie van denaturatie     2.   Elektroforese           Basisprincipes elektroforese  Inleiding Experimentele aspecten          Elektroforese van eiwitten Inleiding Polyacrylamidegel elektroforese Iso-elektrofocussing 2D-elektroforese Elektroforese van nucleïnezuren Inleiding Gelkeuze Detectie Submarine elektroforese Sequentie- en genoomanalyse RNA-elektroforese Pulsed field lektroforese Adsorptie aan membranen - blotten Voordelen van blotten Technieken Membraantypen   3.Chromatografie           Chromatografie Inleiding Begrippen en formules Oplossend vermogen van een kolom Indeling Apparatuur Oefeningen          Gelfiltratiechromatografie Principe Samenstelling van de gelkorrels Zwellen van gelkorrels Verwijderen van lucht Kwantitatieve benadering Fractioneringsbereik Oplossend vermogen Toepassingen Praktische uitvoering Oefeningen Ionenchromatografie Inleiding Elektrostatische aantrekking Ionenuitwisseling Selectiviteitsconstante Ionenuitwisselaars Ionenchromatografie Oefeningen Affiniteitschromatografie Principe Matrix Ligand Spacerarm Elutie Kolomkeuze en stockeren van het gel Oefeningen Hydrofobe interactiechromatografie Principe Uitvoering          Toepassingen STUDIEMATERIAAL cursus "Biochemische technologie" delen biochemische werkwijzen, elektroforese en chromatografie" – auteur: Peter Partoens/Els Van doorslaer – Plantijn Hogeschool 2009. powerpoint presentaties van alle lessen zijn beschikbaar op e-campus- auteur: Peter Partoens – Plantijn Hogeschool 2009. manualen en catalogen van verschillende firma’s. aanbevolen websites staan bij de verschillende hoofdstukken van de cursus vermeld. cursus "Bio-informatica" op e-campus – auteur: Peter Partoens – Plantijn Hogeschool 2009. WERKVORMEN Soort werkvorm uren   % hoor- en werkcolleges: 50  lesuren   30,12 practicum en oefeningen: 0  lesuren   00,00 vormen van groepsleren:  lesuren   00,00 studietijd buiten contacturen: 112  klokuren   67,47 Verdere toelichting: EVALUATIE Eerste examenperiode toetsing INT7-2, tijdens de examenperiode: het examen bestaat uit een schriftelijk en mondeling gedeelte het mondeling gedeelte mag gedurende een korte periode schriftelijk voorbereid worden op het mondeling als het schriftelijk examen worden zowel kennis-, inzichts- als toepassingsvragen gesteld en gepeild naar het redeneervermogen van de student. tijd voor examinering uren 4 %    02,41 Tweede examenperiode 2de zittijd: analoog examen als in 1ste zittijd.