ECTS-database Plantijn Hogeschool
  
 

3 Chemie - 3BI - Onderdelen - Gentechnologie
  

Component behoort tot O.O.: Genexpressie, functie en werking
Afstudeerrichting: CH:Chemie
Code: 30176
Academiejaar: 2009-2010
Type: ?
Niveau: ?
Programmajaar: 3
Periode binnen het modeltraject: :--
Aantal studiepunten: nvt
Wegingscoëfficient: 56
Totaal aantal contacturen: 29
Totaal studietijd: 87,36
Deeltijds programma:
Vrijstelling of overdracht: niet mogelijk
Onderwijstaal: Nederlands
Lector(en): Pittois Karen


 

KORTE OMSCHRIJVING

Dit vak wordt ingeleid met een korte herhaling van de opbouw van ons erfelijk materiaal. De techniek PCR voor de amplificatie van dit erfelijk materiaal wordt uitgebreid behandeld.  Er wordt kennis gemaakt met de technieken en enzymen uit de recombinant DNA technologie. Verder wordt er een introductie gegeven tot de recombinante expressie in prokaryoten en eurkaryoten. Er worden technieken bestudeerd om de expressie van genen uit te schakelen op drie  niveaus (gen-, RNA- en eiwitniveau). Manieren voor de studie van eiwitinteracties worden besproken: yeast two hybrid, faagdisplay en protein arrays.


COMPETENTIEGERICHTE LEERDOELEN
 Dit opleidingsonderdeel draagt in het bijzonder bij tot het realiseren van volgende opleidingsdoelen (eindtermen)

Algemene competenties

  • CH101 zoekt opheldering door het stellen van vragen
Algemene beroepsgerichte competenties
  • CH261 beschermt gevoelige informatie van de organisatie naar de buitenwereld
Beroepsspecifieke competenties

    SPECIFIEKE DOELSTELLINGEN

    De student kent na deze lessenreeks:

    -          Het principe van de PCR reactie, de vereisten en risico’s en de mogelijke detectiesystemen

    -          Varianten en alternatieven voor PCR en hun toepassingen

    -          Kwantitatieve PCR procedures en kan deze beschrijven

    -          De verschillende enzymen die gebruikt worden in de gentechnologie en hun toepassingen

    -          Het gebruik van de verschillende notaties voor nucleotiden

    -          De verschillende stappen voor de aanmaak van recombinant DNA

    -          De verschillende stappen in de aanmaak van een cDNA–bibliotheek

    -          Manieren waarop een DNA-bibliotheek kan gescreend worden

    -          De werking van de toegelichte commerciële kloneringssystemen

    -          De verschillende stappen voor de aanmaak van eiwitten in een prokaryoot expressiesysteem

    -          De technieken waarmee men genactiviteit kan stilleggen voor elke niveau waarop dit mogelijk is (DNA-RNA-eiwit)

    -           

    De student kan:

    -          De verschillende componenten van een PCR reactie benoemen en de hoeveelheden berekenen

    -          De juiste vector aanduiden voor een moleculaire klonering

    -          Het juiste enzym kiezen voor een gentechnologische toepassing

    -          Een prokaryote expressievector tekenen en de verschillende noodzakelijke en optionele onderdelen benoemen

    -          Toelichting geven bij de verschillende eukaryote expressiesystemen

    -          Uitleggen hoe induceerbare expressiesystemen werken en waarom ze gebruikt worden

    -          De verschillende technieken voor de studie van eiwitinteracties opnoemen en de procedures schetsen

    LEERINHOUDEN

    -           PCR: principe, vereisten, componenten van de reactie, risico’s en analyse van de genproducten

    -           PCR: Varianten en alternatieven: hot start, touch down, nested PCR, RT-PCR, e-PCR, PCR-SSCP, ASO-PCR

    -           Kwantitatieve PCR: competitieve PCR en real time PCR

    -           Enzymen gebruikt in de gentechnologie en hun toepassingen

    -           Verschillende notaties voor nucleotiden

    -           Verschillende vectoren en hun gebruik

    -           Aanmaak van recombinant DNA (moleculaire klonering) en transformatie

    o         Blauw-wit screening

    o         Aanmaak van cDNA bibliotheken

    o    Screening van DNA bibliotheken

    o         Universele kloneringstechnieken

    -           Recombinante expressie in prokaryoten:

    o         Klonering, transformatie en zuivering

    -           Expressie in eukaryote systemen:

    o         Expressie in gist

    o         Expressie in dierlijke cellen

    o         Celvrije systemen

    -           Induceerbare expressiesystemen

    -           Gene silencing op 3 niveaus:

    o         Geninactivatie

    o         Post-transcriptionele inactivatie: inactivatie van RNA

    o         Eiwit-inactivatie

    -           Studie van eiwitinteracties:

    o         Yeast two hybrid systeem

    o         Faagdisplay

    o         Protein arrays



    STUDIEMATERIAAL
    • Powerpoint slides beschikbaar op e-campus.
    • Niet verplichte boeken te raadplegen in de bibliotheek:
      • From Genes to Genomes. JW Dale, M van Schantz. 2003. ISBN 978-0-4714-9782-0.
      • Principles of Gene Manipulation. RW Old, SB Primrose. 7de ed. 2007. ISBN 1405135441.(6de editie beschikbaar in PDF)


    WERKVORMEN
    Soort werkvorm uren  

    %

    hoor- en werkcolleges:

    28

     lesuren

      30,11

    practicum en oefeningen:

    0

     lesuren

      00,00

    vormen van groepsleren:

    0

     lesuren

      00,00

    studietijd buiten contacturen:

    64

     klokuren

      68,82

    Verdere toelichting:

     

     


    EVALUATIE

    Eerste examenperiode
    toetsing INT7-1, tijdens de examenperiode

      1. het examen bestaat uit een schriftelijk en mondeling gedeelte.
      2. het mondelinge gedeelte mag gedurende een korte periode schriftelijk voorbereid worden.
      3. op het mondeling als het schriftelijke examen worden zowel kennis-, inzichts- als toepassingsvragen gesteld en gepeild naar het redeneervermogen van de student.

    tijd voor examinering
    uren
    1

    %
     
     01,08

    Tweede examenperiode
    Idem